nVidia Quadro K5000 with 4 GB DDR5 dedicated memory
Écrans
HP 27bw 27" 1920 x 1080
Dell S2721D 27" 2560 x 1440
Logiciels
Imaris v7.5
Autoquant X3.13
Zen Lite 3.13
ICY
ImageJ
FIJI
R
RStudio
VLC
Bulk Rename utility
Guide d'utilisation
Si ce n’est pas déjà fait,allumezl’ordinateur(#1)et connectez-vous à Windows en utilisant vos identifiants UdeM
Les logiciels disponibles se trouvent sur le Bureau dans le dossier Software
Les fichiers peuvent être sauvéstemporairement(pendant l'utilisation) sur le disque local C: (bureau)
À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe etsupprimez-les du disque local C:
Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. A l’intérieur créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).
Dans tous les cas,ne stockez pas vos fichiers sur le disque C:
Enregistrez vos données
Fermez le logiciel
Transférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe etles supprimer du disque local C:
Ceci peut survenir lorsque les fichiers utilisés ne contiennent pas l'ensemble des métadonnées.
Assurez vous de sauvegarder vos fichiers avec toutes les métadonnées disponibles lors de l'acquisition au microscope. Habituellement cela nécessite de sauvegarder les fichiers dans le format propriétaire du logiciel utilisé (.nd2 pour NIS-Elements, .nd pour Metamorph, .czi pour Zen,...)
Vous pouvez également ajouter les données de calibration après l'acquisition (taille des pixels en XY et Z, longueur d'onde, distance du pas en Z)
FAQ
Oui ! Contactez-nous pour faire une demande de permission au responsable de la plateforme. Note: Il n'est pas possible de démarrer les logiciels à distance. Il est cependant possible de les demarrer localement puis d'y accéder à distance.
Il n'y a pas une seule réponse à cette question:
Si vous avez une image avec un seul plan en Z vous devriez choisir l'option 2D-deconvolution
Si vous avez plusieurs plans en Z vous devriez choisir l'option 3D-deconvolution.
Si vous souhaitez obtenir une visualisation rapide du résultat de déconvolution vous devriez choisir la méthode Fast Deconvolution