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id | Description |
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title | Description |
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| Microscope à haut débit GE InCell INCell Analyzer 6000Pavillon JA Bombardier, Local 3129 Tarif d'utilisation Microscope Avancé tier 2 Instrument octroyé au Dr Steve Michnick par la Fondation Canadienne pour l'Innovation (FCI) Tarif d'utilisation Microscope Avancé tier 2 - Applications
- Lumière transmise
- Pseudo contraste de phase et DIC
- Fluorescence
- Imagerie à haut débit
- Imagerie longue durée
Sources lumineuses
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title | Caractéristiques complètes du Toptica iChrome |
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lumineuse | Polychroïque | Longueurs d'onde d'excitation | Fluorophores compatibles | Puissance nominale (mW) |
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405nm | 390/40 | [370-410] | DAPI, Hoechst | 50 | 488nm | 482/18 | [473-491] | FITC, GFP, YFP | 25 | 561nm | | [559-569] | Cy3, DsRed, TxRed | 30 | 642nm | 640/14 | [632-647] | Cy5, Cy5.5 | 50 |
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Objectifs - 10x/0.45 Air WD 4.0
- 20x/0.75 Air WD 1.0
- 40x/0.6 Air WD 2.7-3.7
- 60x/0.95 Air WD 0.15
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title | Caractéristiques complètes des objectifs |
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Position | Nom | Marque | Nom complet | Identifiant | Grossissement | Ouverture numérique | Immersion | Type | Distance de travail (mm) | Transmittance (% [nm]) | Technique | Épaisseur du couvre-objet (mm) |
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1 | 10x/0.45 Air | Nikon | 10x/0.45 Air Plan Apo M25x0.75 | MRD0010120x | 0.5 | Air | Plan Fluor | 4.0 | >80% [TBD-TBD] | BF, p-PhC, p-DIC, Fluo | 0.17 | 2 | 20x/0.75 Air | Nikon | 20x/0.75 Air Plan Apo DIC N2 M25x0.75 | MRD0020160x | 1.4Air | Plan Apo | 1.0 | >80% [TBD-TBD] | BF, p-PhC, p-DIC, Fluo | 0.17 | 3 | | Nikon | 40x/0.6 Air Plan Fluor ELWD M25x0.75 | MRH08430 | 100x | 1.45 | AirPlan Fluor | 2.7-3.7 | >80% [TBD-TBD] | BF, p-PhC, p-DIC, Fluo | 0.17 | 4 | 60x/0.95 Air | Nikon | 60x/0.95 Air Plan Apo M25x0.75 | MRD00600 | 100x | 1.45 | AirPlan Apo | 0.15 | >80% [TBD-TBD] | BBF, p-PhC, p-DIC, Fluo | 0.17 |
BF: Champ clair (Bright-field) p-PhC: Pseudo-contraste de phase p-DIC: Pseudo-contraste d'interférence différentiel |
- FiltresCubes de filtres
DAPI GFP Cy3 Cy5 - Cy5.5
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title | Caractéristiques complètes des filtres |
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Position | Nom | Marque | Identifiant | Miroir polychroïque (Transmission) | Filtre d'émission | Bande passante effective (nm) |
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1 | DAPI | TBD | TBD | BP 420/20 [430-462] | 455/50 [430-480] | [430-480] | 2 | GFP | TBD | TBD | BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137 | 525/20 [515-535] | [515-535] | 3 | Cy3 | TBD | TBD | BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137 | 605/52 [579-631] | [582-618] | 4 | Cy5 | TBD | TBD | BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137 | 707/72 [671-743] | [671-743] | 5 | Cy5.5 | TBD | TBD | BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137 | 720/60 [690-750] | [690-750] |
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- Détecteur
- sCMOS Monochrome 2560 x 2160 pixels, 16-bit, pixel 6.5um x6x 6.5um, capteur 16.6mm x 14.0mm
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id | Guide d'utilisation |
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title | Guide d'utilisation |
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expanded | true |
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title | Démarrage |
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| Si nécessaire, allumez Allumez le du microscope (#1) Info |
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| L’interrupteur n’est pas facilement accessible et se trouve à l’arrière du côté droit de l’appareil |
- Si nécessaire, allumez Allumez l’ordinateur (#2)
- Utilisez vos identifiants UdeM pour vous connecter à Windows
Démarrez le logiciel IN Cell Analyzer 6000
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UI Expand |
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| Dans le logiciel IN Cell Analyzer: - Cliquez sur Eject pour ouvrir la porte d'accès
- Insérer votre échantillon dans l'espace prévu à cet effet en respectant l'orientation indiquée
Cliquez sur Load pour fermer la porte d'accès Info |
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title | Première utilisation |
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| Lors de la formation vous allez suivre le protocol de Première utilisation |
Note |
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| Pour une utilisation avec l'objectif 60x il est absolument nécessaire d'utiliser une plaque multi-puits avec un fond de verre. L'épaisseur de verre doit être de 0.17mm. Nous recommandons les plaques suivantes: Link in New Window |
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linkText | Greiner SensoPlate plus 96-well plate #655891 |
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href | https://shop.gbo.com/en/row/products/bioscience/microplates/sensoplate-glass-bottom-plates/bs-sensoplate-plus/655891.html |
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Link in New Window |
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linkText | Nunc Optical CVG 96-well 164588 |
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href | https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/164588 |
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| UI Expand |
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| - Récuppérez vos échantillons
- Cliquez sur Load pour refermer la porte d'accès
- Fermez le logiciel In Cell Analyzer
- Transférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C:
- Éteindre l'ordinateur
Note |
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| - Récupérez vos échantillons notamment ceux dans le microscope
- Laissez le microscope et l’espace de travail propre
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UI Expand |
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| - Les fichiers peuvent être sauvés temporairement (pendant l’acquisition) sur le disque local C: (bureau)
- À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe et supprimez-les du disque local C:
- Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. A l’intérieur créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).
note
| | Dans tous les cas, ne stockez pas vos fichiers sur le disque C: |
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title | Première utilisation |
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| Anchor |
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Premiere-utilisation | Premiere- | Lors de la première utilisation, il est nécessaire de définir le type de plaque utilisée. UI Expand |
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title | Créer une nouvelle plaque |
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| Dans le logiciel IN Cell Analyzer: - Sélectionnez dans le menu Application>Plate\Slide Manager...
- Cliquez sur l'icone New Plate\Slide
- Sélectionnez le nombre de puits de votre plaque (6, 24, 96 etc...)
- Ajustez les paramètres suivants:
- Nom: Votre-Nom_Votre-plaque
- Hauteur de plaque, épaisseur du fond et volume du puit (Plate height, Bottom Thickness, well volume) habituellement fournis dans la fiche technique du produit par le manufacturier
- Le matériau utilisé plastique ou verre (Plastic or Glass)
- Si nécessaire ajustez le nombre de lignes et de colonnes ainsi que la forme du puit (rond ou rectangulaire)
- Cliquez sur OK
- Fermez la fenêtre du Plate/Slide Manager
| Mesurer la hauteur et épaisseur du fond de plaqueécart du puit A1 (Offset) |
| Dans le logiciel | IN In Cell Analyzer: - Cliquez sur le Dashboard
- Dans Objective Lens selectionnez l'objectif 10x
- Dans Plate/Slide... selectionner la plaque nouvellement cree
- Dans Objective Lens selectionnez l'objectif 10x
- Dans la liste des canaux, cliquez sur le bouton + et ajoutez un canal en lumière transmise (brightfield)
- À droite du plan de la plaque, cliquez sur le bouton Setup Preview Imaging
- Dessinez un rectangle autour du puit A1
- Cliquez sur preview (sur le panneau d'acquisition en haut à droite de l'écran)
- Attendre que la prévisualisation soit générée
- Sur le plan de la plaque, cliquez sur le centre
| d'un puit contenant un échantillon - réel du puit A1 pour centrer ce puit sur l'objectif
| Dans Dans le menu du Dashboard sélectionnez Plate/Slide Cliquez sur
| Verify LAFSi les 2 pics détéctés (lignes verticales bleues) correspondent aux pics mesurés (courbe noire)- Cliquez sur Apply Measured Parameters
- Cliquez sur OK
- Cliquez sur Yes
Si les 2 pics détéctés (lignes verticales bleues) ne correspondent aux pics mesurés (courbe noire),- Modifiez la valeur du bottom thickness et répétez l'opération.
Fermez la fenêtre Laser Autofocus Plate/Slide VerificationMesurer l'écart du puit A1 (Offset) Edit Plate puis sur Define Upper Left Well Cliquez sur Yes - Vérifiez que le cercle jaune coincide avec les bords du puit
Cliquez sur Yes
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UI Expand |
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title | Calculer la distance inter-puits |
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| Dans le logiciel In Cell Analyzer: - Cliquez sur le Dashboard
- Dans Objective Lens selectionnez l'objectif 10x
- Dans Plate/Slide... selectionner la plaque nouvellement cree
- Dans Objective Lens selectionnez l'objectif 10x
- Dans la liste des canaux, cliquez sur le bouton + et ajoutez un canal en lumière transmise (brightfield)
- À droite du plan de la plaque, cliquez sur le bouton Setup Preview Imaging
- Dessinez un rectangle autour du dernier puit
| A1- en bas à droite
- Cliquez sur preview (sur le panneau d'acquisition en haut à droite de l'écran)
- Attendre que la prévisualisation soit générée
- Sur le plan de la plaque, cliquez sur le centre réel du puit A1 pour centrer ce puit sur l'objectif
Dans le menu du Dashboard sélectionnez Plate/Slide Cliquez sur Edit Plate puis sur Define
| Upper Left Lower Right Well Cliquez sur Yes
| Vérifiez - La distance inter-puits sera ensuite automatiquement calculée
- Vérifiez que le cercle jaune coincide avec les bords du puit
Cliquez sur Yes
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Calculer la distance inter-puits
Répétez les étapes du Offset pour le puit en bas à droite La distance inter-puits sera ensuite automatiquement calculée UI Expand |
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title | Mesurer la hauteur et l'épaisseur du fond de plaque |
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| Dans le logiciel IN Cell Analyzer: - Cliquez sur le Dashboard
- Sur le plan de la plaque cliquez sur le centre d'un puitcontenant un échantillon pour centrer ce puit sur l'objectif
- Dans le menu du Dashboard sélectionnez Plate/Slide
- Cliquez sur Verify LAF
- Si les 2 pics détéctés (lignes verticales bleues) correspondent aux pics mesurés (courbe noire)
- Cliquez sur Apply Measured Parameters
- Cliquez sur OK
- Cliquez sur Yes
- Si les 2 pics détéctés (lignes verticales bleues) ne correspondent aux pics mesurés (courbe noire)
- Modifiez la valeur du bottom thickness et répétez l'opération
- Fermez la fenêtre Laser Autofocus Plate/Slide Verification
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| - Les fichiers peuvent être sauvés temporairement (pendant l’acquisition) sur le disque local C: (bureau)
- À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe et supprimez-les du disque local C:
- Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. A l’intérieur créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).
Note |
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| Dans tous les cas, ne stockez pas vos fichiers sur le disque C: |
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UI Expand |
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| - Récuppérez vos échantillons
- Cliquez sur Load pour refermer la porte d'accès
- Fermez le logiciel In Cell Analyzer
- Transférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C:
- Éteindre l'ordinateur
Note |
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| - Récupérez vos échantillons notamment ceux dans le microscope
- Laissez le microscope et l’espace de travail propre
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id | Trajet lumineux |
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title | Trajet lumineux |
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| Les schémas suivants permettent de suivre le trajet lumineux en lumière transmise (fond clair) et en lumière réfléchie (fluorescence). Ces schémas seront disponibles prochainement. View file |
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name | Plate_Diagram.pdf |
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height | 250 |
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| Manuels disponibles en version anglaise seulement. |
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id | Fiche Technique |
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title | Fiche Technique |
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| Section disponible dans la version anglaise. |
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id | Dépannage et FAQ |
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title | Dépannage et FAQ |
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| Dépannage UI Expand |
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title | Le microscope n'affiche pas la lumière verte habituelle, que faire? |
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| Habituellement, ce microscope affiche une lumière verte lorsqu'il est opérationel et une lumière orange lorsqu'il est en cours d'utilisation. Une lumière rouge est allumée signifie que le microscope n'est pas fonctionnel. Dans ce cas v euillez veuillez contacter le responsable de la plateforme.
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FAQ UI Expand |
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title | Puis-je utiliser ce microscope pour observer des cellules en culture? |
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| Oui. Ce microscope est conçu pour l'acquisition à haut-débit de spécimen en plaques multi-puits. Le microscope peut controller la temperature mais ne dispose pas d'une chambre environementale. Vous pouvez également faire l'acquisition d'images de specimen entre lame et lamelle (épaisseur 0.17mm) |
UI Expand |
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title | Comment éteindre le microscope? |
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| Habituellement le microscope reste allumé. Cependant, il est préférable de l'éteindre en cas de non-utilisation prolongée. Pour ce faire: - Naviguez dans le menu Application> Hardware>
- Cliquez sur Shutdown Instrument
- Attendre que le microscope s'éteigne
- Le logiciel se ferme automatiquement
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Plus de dépannage et de FAQs sont disponibles dans la version anglaise. |
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