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Département UFR 927 Sciences de la vie


Colonne

Professeure

Catherine Vénien-Bryan     

catherine.venien-bryan@sorbonne-universite.fr


Colonne


Département de biochimie

Dr. Jurgen

Sygush

Sygusch

Professeur

MU5BM107/BCM 6225 - Enzymologie moléculaire et mécanistique

  • L’objectif du Cours est de fournir une formation approfondie en enzymologie en insistant sur la compréhension fine de l’enzymologie mécanistique.
  • Des connaissances avancées en enzymologie moléculaire, cellulaire et pharmaceutique seront au programme de même que l’analyse critique des systèmes et des réactions enzymatiques.
  • Familiarisation avec les expertises complémentaires dans la démarche moderne de l’enzymologie, par des études de cas à l’intersection de la biochimie et d’autres disciplines telles que la chimie, la biologie moléculaire, la pharmacologie, la microbiologie, la bio-informatique ou la physique.
  • Compréhension de plusieurs maladies au niveau moléculaire et des bases nécessaires à la conception rationnelle et au développement de drogues contre des maladies. 


Mis à jour :   Date couranteNameMis à jour
Dates des examens partiels

  1. 4 13 octobre, 20212023 à 9h00 --> 11h00 - salle B-328 4079 (PJAB) UdeM
  2. 29 octobre6 novembre, 20212023 à 9h00 --> 11h00 - salle B-328 4079 (PJAB) UdeM
  3. 29 novembre4 décembre, 20212023 à 9h00 --> 11h00 - salle B-328 salle4079 (PJAB) UdeM


Notes du cours
 Partie I: Enzymologie mécanistique

  • Introduction à l'enzymologie
    • Enzymologie, aspects fondamentaux, passés et présents. Les caractéristiques de l’action enzymatique. Éléments d’analyse basés sur le modèle de Michaelis et l’apport de l’enzymologie de la molécule unique.
  • Mécanismes réactionnels des enzymes
    • Chemical catalysis; classical transition state theory, catalytic principles, structure-activity relationships, and kinetic isotope effects - Cofactors: reaction mechanism of typical enzymes ; Metallo-enzymes
  • Activité enzymatique 
    • La chimie Bioinorganique et bioinspirée. Cette activité s'exerce à la frontière de la chimie et de la biologie et s'étend de la synthèse chimique à la biologie moléculaire. La convergence de la biologie, de l'enzymologie, de la spectroscopie et de la chimie est dirigée vers un seul et même but : reproduire, voire améliorer l'activité enzymatique grâce à l'étude de la structure et de la réactivité des enzymes.
  • Activité ribozyme 
  • Regulation allostérique
    • Allostérie, coopérativité, régulation de l'activité enzymatique, modifications réversibles


 Partie II: Enzymologie moléculaire
"Nul ne saurait comprendre la nature si celui-ci ne connaît son langage qui est le langage mathématique"- Pascal

  • Approches expérimentales en enzymologie
    • Effets de l'environnement sur les enzymes – pH, microenvironnement; détection et structure des intermédiaires réactionnels; techniques expérimentales et computationnelles en cinétiques des enzymes, enzymologie in vivo
    • Biocristallographie résolue en temps, introduction sur les différentes approches cinétiques, exemples portant sur l'identification du chemin réactionnel in cristallo. Nouveaux outils: laser à électrons libres, nouveaux synchrotrons.
  • Dynamiques enzymatiques
    • Modélisation moléculaire et dynamique en détaillant les champs de force, la fonction des énergies potentielles, simulation de l'environnement. Les différentes méthodes de simulation. Les modes normaux. Géométries d'attaque, inhibition de l'état de transition, modelage moléculaire des interactions enzyme-substrat
  • Génie des protéines et biotechnologies
    • Stratégies de mutations afin d'améliorer l'activité et la stabilité enzymatiques, enzymes de bioconversion, nouvelles activités enzymatiques


 Partie III: Enzymologie cellulaire et pharmaceutique

  • Kinome
  • Métabolomiques et voies enzymatiques dans les maladies et le vieillissement 
    • Détection des métabolites, profilage des métabolites, flux des voies métaboliques et traitements médicamenteux.
  • Processus de découverte des médicaments: une façon de faire (parmi d'autres)
    • transférase, réductase, phospholipase, HIV protéase, protéome, criblage à haute efficacité, caractérisation biophysique, biologie structurale


Additional information

Stages :

    Les étudiants sont encouragés à contacter les instructeurs du Cours concernant la possibilité de stages à effectuer dans les diverses institutions pendant la session d’hiver.