Département UFR 927 Sciences de la vie
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ProfesseureCatherine Vénien-Bryan |
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MU5BM107/BCM 6225 - Enzymologie moléculaire et mécanistique
- L’objectif du Cours est de fournir une formation approfondie en enzymologie en insistant sur la compréhension fine de l’enzymologie mécanistique.
- Des connaissances avancées en enzymologie moléculaire, cellulaire et pharmaceutique seront au programme de même que l’analyse critique des systèmes et des réactions enzymatiques.
- Familiarisation avec les expertises complémentaires dans la démarche moderne de l’enzymologie, par des études de cas à l’intersection de la biochimie et d’autres disciplines telles que la chimie, la biologie moléculaire, la pharmacologie, la microbiologie, la bio-informatique ou la physique.
- Compréhension de plusieurs maladies au niveau moléculaire et des bases nécessaires à la conception rationnelle et au développement de drogues contre des maladies.
Mis à jour :
Dates des examens partiels
- 4 13 octobre, 20212023 à 9h00 --> 11h00 - salle B-328 4079 (PJAB) UdeM
- 29 octobre6 novembre, 20212023 à 9h00 --> 11h00 - salle S1-131salle 4079 (PJAB) UdeM
- 29 novembre4 décembre, 20212023 à 9h00 --> 11h00 - salle B-328 salle4079 (PJAB) UdeM
- Horaire du cours
- Practicing biochemistry without a licence
- Engineering Life
- Careers in Enzyme Expertise
- Enzyme Kinetics, Past and Present
Notes du cours
Partie I: Enzymologie mécanistique
- Introduction à l'enzymologie
- Enzymologie, aspects fondamentaux, passés et présents. Les caractéristiques de l’action enzymatique. Éléments d’analyse basés sur le modèle de Michaelis et l’apport de l’enzymologie de la molécule unique.
- Michèle Reboud Lien Zoom revisé 19 13/11/20202023
- Enzymologie, aspects fondamentaux, passés et présents. Les caractéristiques de l’action enzymatique. Éléments d’analyse basés sur le modèle de Michaelis et l’apport de l’enzymologie de la molécule unique.
- Mécanismes réactionnels des enzymes
- Chemical catalysis; classical transition state theory, catalytic principles, structure-activity relationships, and kinetic isotope effects - Cofactors: reaction mechanism of typical enzymes ; Metallo-enzymes
- Myriam Seemann Lien Zoom revisé 2229/11/20192023
- Chemical catalysis; classical transition state theory, catalytic principles, structure-activity relationships, and kinetic isotope effects - Cofactors: reaction mechanism of typical enzymes ; Metallo-enzymes
- Activité enzymatique
- La chimie Bioinorganique et bioinspirée. Cette activité s'exerce à la frontière de la chimie et de la biologie et s'étend de la synthèse chimique à la biologie moléculaire. La convergence de la biologie, de l'enzymologie, de la spectroscopie et de la chimie est dirigée vers un seul et même but : reproduire, voire améliorer l'activité enzymatique grâce à l'étude de la structure et de la réactivité des enzymes.
- Activité ribozyme
- Structure-fonction, mécanisme, cofacteurs.
- Beatrice Golinelli Lien Zoom revisé 16révisé 10/11/20202022
- Structure-fonction, mécanisme, cofacteurs.
- Regulation allostérique
- Allostérie, coopérativité, régulation de l'activité enzymatique, modifications réversibles
- Pierre-Jean Corringer
- Cours révisé Lien Zoom nouveau 03/10/18/20212023
- Pierre-Jean Corringer
- Allostérie, coopérativité, régulation de l'activité enzymatique, modifications réversibles
Partie II: Enzymologie moléculaire
"Nul ne saurait comprendre la nature si celui-ci ne connaît son langage qui est le langage mathématique"- Pascal
- Approches expérimentales en enzymologie
- Effets de l'environnement sur les enzymes – pH, microenvironnement; détection et structure des intermédiaires réactionnels; techniques expérimentales et computationnelles en cinétiques des enzymes, enzymologie in vivo
- Biocristallographie résolue en temps, introduction sur les différentes approches cinétiques, exemples portant sur l'identification du chemin réactionnel in cristallo. Nouveaux outils: laser à électrons libres, nouveaux synchrotrons.
- Dominique Housset Lien Zoomrevisé 29/11/20202023
- Effets de l'environnement sur les enzymes – pH, microenvironnement; détection et structure des intermédiaires réactionnels; techniques expérimentales et computationnelles en cinétiques des enzymes, enzymologie in vivo
- Dynamiques enzymatiques
- Modélisation moléculaire et dynamique en détaillant les champs de force, la fonction des énergies potentielles, simulation de l'environnement. Les différentes méthodes de simulation. Les modes normaux. Géométries d'attaque, inhibition de l'état de transition, modelage moléculaire des interactions enzyme-substrat
- Génie des protéines et biotechnologies
- Stratégies de mutations afin d'améliorer l'activité et la stabilité enzymatiques, enzymes de bioconversion, nouvelles activités enzymatiques
- Joelle Pelletier Lien Zoom revisé 2017/0910/20212023
- Stratégies de mutations afin d'améliorer l'activité et la stabilité enzymatiques, enzymes de bioconversion, nouvelles activités enzymatiques
Partie III: Enzymologie cellulaire et pharmaceutique
- Kinome
- Les protéines kinases comme cibles thérapeutiques, pathologies.
- Catherine Vénien-Bryan Lien Zoomrevisé 17 révisé 19/09/20212023
- Les protéines kinases comme cibles thérapeutiques, pathologies.
- Métabolomiques et voies enzymatiques dans les maladies et le vieillissement
- Détection des métabolites, profilage des métabolites, flux des voies métaboliques et traitements médicamenteux.
- Matthieu Ruiz Lien Zoomrevisé 19 révisé 14/09/20212022
- Détection des métabolites, profilage des métabolites, flux des voies métaboliques et traitements médicamenteux.
- Processus de découverte des médicaments: une façon de faire (parmi d'autres)
- transférase, réductase, phospholipase, HIV protéase, protéome, criblage à haute efficacité, caractérisation biophysique, biologie structurale
- Gilles Ferry Lien Zoom 31/10/2023
- Gilles Ferry - les éléments à connaître 08
- Partie 1 revisé 26/11/2020 Partie 2 revisé 26/11/20202022
- Michèle Reboud Lien Zoomrevisé 2221/11/20202023
- transférase, réductase, phospholipase, HIV protéase, protéome, criblage à haute efficacité, caractérisation biophysique, biologie structurale
Additional information
Stages :
- Les étudiants sont encouragés à contacter les instructeurs du Cours concernant la possibilité de stages à effectuer dans les diverses institutions pendant la session d’hiver.