L'EBSI est dirigée par le directeur qui est nommé pour quatre ans. L'assemblée départementale se réunit normalement une fois tous les deux mois de septembre à mai. Les membres (votants) sont les professeurs réguliers, les représentants étudiants et le représentant des chargés de cours.
La structure de l'ensemble des comités (incluant ceux qui n'ont pas de représentants étudiants ou représentant des chargés de cours) et la description de leur mandat se trouve en Annexe 1.
Depuis 2014, un nouveau comité a été créé, le CACH (Comité d'accueil des chargés de cours). Son mandat est d'accueillir les chargés de cours, de les aviser de toute mise à jour de la documentation et d'être le répondant principal. Il est composé de Dominique Maurel, professeure agrégée, d'Isabelle Dion, coordonnatrice de stages, d'Arnaud d'Alayer, responsable des laboratoires informatique documentaire, de Sarah Pasutto, technicienne en coordination du travail de bureau) et est présidé par Christine Dufour, professeure agrégée. La personne contact de première ligne est Sarah Pasutto.