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Microscope à haut débit GE InCell Analyzer 6000

Pavillon JA Bombardier, Local 3129
Instrument octroyé au Dr Steve Michnick par la Fondation Canadienne pour l'Innovation (FCI)

  • Applications
    • Lumière transmise
    • Pseudo- contraste de phase et DIC
    • Fluorescence
    • Imagerie à haut débit
    • Imagerie longue durée
  • Sources lumineuses

    • LED pour la lumière transmise

    • Toptica iChrome MLE pour la fluorescence

Source lumineusePolychroïqueLongueurs d'onde d'excitationFluorophores compatiblesPuissance nominale
(mW)
405nm390/40[370-410]DAPI, Hoechst50
488nm

482/18

[473-491]FITC, GFP, YFP

25

561nm

564/9

[559-569]

Cy3, DsRed, TxRed

30
642nm640/14[632-647]

Cy5, Cy5.5

50

  • Objectifs

    1. 10x/0.45 Air WD 4.0
    2. 20x/0.75 Air WD 1.0
    3. 40x/0.6 Air WD 2.7-3.7
    4. 60x/0.95 Air WD 0.15


PositionNomMarqueNom completIdentifiantGrossissementOuverture numériqueImmersionTypeDistance de travail (mm)Transmittance
(% [nm])
TechniqueÉpaisseur du couvre-objet (mm)
110x/0.45 AirNikon

10x/0.45 Air
Plan Apo
M25x0.75

TBD20x0.5AirPlan Fluor4.0>80% [TBD-TBD]BF, p-PhC, p-DIC, Fluo0.17
2

20x/0.75 Air

Nikon20x/0.75 Air
Plan Apo
DIC N2
M25x0.75
TBD60x

1.4

Air
Plan Apo1.0>80% [TBD-TBD]BF, p-PhC, p-DIC, Fluo0.17
3

40x/0.6 Air

Nikon40x/0.6 Air
Plan Fluor Ph2
M25x0.75
TBD

100x

1.45
Air
Plan Fluor2.7-3.7>80% [TBD-TBD]BF, p-PhC, p-DIC, Fluo0.17
460x/0.95 Air Nikon60x/0.95 Air 
Plan Apo
M25x0.75
TBD

100x

1.45

Air
Plan Apo0.15>80% [TBD-TBD]BBF, p-PhC, p-DIC, Fluo0.17

BF: Champ clair (Bright-field)
p-PhC: Pseudo-contraste de phase
p-
DIC: Pseudo-contraste d'interférence différentiel

  • Cubes de filtres
    1. DAPI

    2. GFP

    3. Cy3

    4. Cy5

    5. Cy5.5
PositionNomMarqueIdentifiantMiroir polychroïqueFiltre d'émissionCommentaires
1DAPITBDTBDBP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137445/50
[420-470]
C-FL-C DAPI-U HQ
2GFPTBDTBD

BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137

525/20
[515-535]
Nikon ID 96372
3Cy3TBD

TBD

BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137605/52
[579-631]
Nikon ID 96376
4

Cy5

TBD

TBD

BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137707/72
[671-743]
77074160 Custom Quad C182279.
Les filtres d'excitation sont inclus dans la source lumineuse Lumencor Spectra X 
5

Cy5.5

TBDTBDBP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137720/60
[690-750]
Requis pour l'imagerie DIC
  • Détecteur
    • Hamamatsu ORCA Flash V2 C11440-22CU CMOS Monochrome 2048 x 2048 pixels, 16-bit, 30 images/s à pleine résolution


  1. Allumez l’ordinateur (#1)
  2. Retirer la housse de protection du microscope
  3. Allumez la multiprise d’alimentation à droite du microscope (#2)
  4. Si l'incubation est nécessaire, allumez le module d'incubation Okolab (#3A) et le bain-marie (#3B) et ouvrez les bonbonnes de CO2 (#3C) et d'azote N2 (#3D)

    Assurez-vous que le bain-marie et l'humidificateur soient proprement remplis avec de l'eau distillée

  5. Utilisez vos identifiants UdM pour vous connecter à Windows

  6. Démarrez le logiciel NIS-Elements

    Lors de la première utilisation il est nécessaire d’importer les paramètres du microscope dans le logiciel avant de le démarrer. Pour ce faire, suivre les instructions Paramétrage du logiciel.

Sur le microscope:

  1. Poussez délicatement le bras de la lumière transmise du microscope vers l'arrière
  2. Appuyez sur Escape (ESC) pour faire descendre les objectifs
  3. Sélectionnez l'objectif 4x
  4. Installez l'échantillon de test visible à l'oeil nu sur l'encart en vérifiant de bien mettre la lamelle du coté de l'objectif
  5. Centrez l'échantillon sur l'objectif à l'aide du joystick
  6. Remettez délicatement le bras de la lumière transmise du microscope vertical
  7. Appuyez une nouvelle fois sur Escape (ESC) pour remettre les objectifs en position normale

Dans le logiciel NIS-Elements:

  1. Cliquez sur la configration optique Brightfield (BF)
  2. Cliquez sur Live (»)
  3. Ajustez l'intensité lumineuse et la durée d'exposition pour obtenir une image correctement exposée
  4. Ajustez le focus pour obtenir une image nette (le focus est réalisé autour de Z=2100)

    Truc & Astuce

    Appuyez sur Crtl+F pour utiliser la fonction autofocus du logiciel

  5. Appuyez sur Escape (ESC) pour faire descendre les objectifs
  6. Vous pouvez ensuite retirer l'échantillon de test et installer votre échantillon d'intérêt
  7. Appuyez une nouvelle fois sur Escape (ESC) pour remettre les objectifs en position normale, votre échantillon sera déjà au focus
  1. Enregistrez vos données
  2. Fermez le logiciel NIS-Elements
  3. Transférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C:
  4. Éteindre l'ordinateur
  5. Si utilisés, nettoyez les objectifs à huile avec du nettoyant et du papier à lentille
  6. Si l'incubation a été utilisée, éteindre le module d'incubation Okolab (#3A) et le bain-marie (#3B) et fermez les bonbonnes de CO2 (#3C) et d'azote N2 (#3D)
  7. Attendre que le refroidissement du Spectra X soit terminé et éteindre la multiprise d’alimentation du microscope (#2)
  8. Couvrir l’instrument avec la housse de protection

Rappels Importants

  • Récupérez vos échantillons notamment ceux dans le microscope
  • Laissez le microscope et l’espace de travail propre
  • Les fichiers peuvent être sauvés temporairement (pendant l’acquisition) sur le disque local C: (bureau)
  • À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe et supprimez-les du disque local C:
  • Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. A l’intérieur créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).

Dans tous les cas, ne stockez pas vos fichiers sur le disque C:

Lors de la première utilisation, il est nécessaire d’importer dans le logiciel les paramètres spécifiques au microscope. Cette procédure est habituellement réalisée lors de la séance de formation.
Il est cependant également possible de l’utiliser pour réinitialiser le logiciel si celui-ci ne s‘affiche pas correctement par exemple. 

Attention, cette procédure rétablira les paramètres originaux du logiciel et supprimera tous vos protocoles et paramètres personnels.

  1. Si ouvert, fermez le logiciel NIS-Elements et attendre sa fermeture complète (jusqu’à 30 secondes)
  2. Sur le Bureau ouvrez le dossier Softwares
  3. Ouvrez le logiciel NIS Settings Utility
  4. Cliquez sur l’onglet Import
  5. Cliquez sur Browse
  6. Naviguez jusqu’à votre bureau
  7. Sélectionnez le fichier Nikon-Ti2 Settings.bin
  8. Cliquez Open
  9. Sélectionnez tous les items
  10. Cliquez Import
  11. Cliquez OK
  12. Fermez le logiciel NIS Settings Utility
  13. Vous pouvez ensuite réouvrir le logiciel NIS-Elements


Les schémas suivants permettent de suivre le trajet lumineux en lumière transmise (fond clair, contraste de phase) et en lumière réfléchie (fluorescence).

Erreur de création de la macro 'viewpdf'

com.atlassian.confluence.macro.MacroExecutionException: com.atlassian.confluence.macro.MacroExecutionException: The viewfile macro is unable to locate the attachment "LightPath_Nikon Ti2.pdf" on this page

Section disponible dans la version anglaise.


Section disponible dans la version anglaise.

Le microscope n'affiche pas la lumière verte habituelle, que faire?

  • Habituellement, ce microscope affiche une lumière verte lorsqu'il est opérationel et une lumière orange lorsqu'il est en cours d'utilisation.
  • Une lumière rouge est allumée signifie que le microscope n'est pas fonctionnel. Dans ce cas veuillez contacter le responsable de la plateforme.

Puis-je utiliser ce microscope pour observer des cellules en culture?

  • Non. Ce microscope est conçu pour l'acquisition à haut-débit de spécimen en plaques multi-puits.
  • Vous pouvez également faire l'acquisition d'images de specimen entre lame et lamelle (épaisseur 0.17mm)


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