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titleEnglish
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idInstrument Tab container
titleInCell Analyzer
directionhorizontal


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idDescription
titleDescription


Microscope à haut débit GE InCell Analyzer 6000

Pavillon JA Bombardier, Local 3129
Instrument octroyé au Dr Steve Michnick par la Fondation Canadienne pour l'Innovation (FCI)

  • Applications
    • Lumière transmise
    • Pseudo contraste de phase et DIC
    • Fluorescence
    • Imagerie à haut débit
    • Imagerie longue durée

  • Sources lumineuses

    • LED pour la lumière transmise

    • Toptica iChrome MLE pour la fluorescence

Développer
titleCaractéristiques complètes du Toptica iChrome


Source lumineusePolychroïqueLongueurs d'onde d'excitationFluorophores compatiblesPuissance nominale
(mW)
405nm390/40[370-410]DAPI, Hoechst50
488nm

482/18

[473-491]FITC, GFP, YFP

25

561nm

564/9

[559-569]

Cy3, DsRed, TxRed

30
642nm640/14[632-647]

Cy5, Cy5.5

50



  • Objectifs

    1. 10x/0.45 Air WD 4.0
    2. 20x/0.75 Air WD 1.0
    3. 40x/0.6 Air WD 2.7-3.7
    4. 60x/0.95 Air WD 0.15
Développer
titleCaractéristiques complètes des objectifs


PositionNomMarqueNom completIdentifiantGrossissementOuverture numériqueImmersionTypeDistance de travail (mm)Transmittance
(% [nm])		TechniqueÉpaisseur du couvre-objet (mm)
110x/0.45 AirNikon

10x/0.45 Air
Plan Apo
M25x0.75

MRD0010120x0.5AirPlan Fluor4.0>80% [TBD-TBD]BF, p-PhC, p-DIC, Fluo0.17
2

20x/0.75 Air

Nikon20x/0.75 Air
Plan Apo
DIC N2
M25x0.75		MRD0020160x

1.4


Air


Plan Apo1.0>80% [TBD-TBD]BF, p-PhC, p-DIC, Fluo0.17
3

40x/0.6 Air

Nikon40x/0.6 Air
Plan Fluor ELWD
M25x0.75		MRH08430

100x

1.45


Air


Plan Fluor2.7-3.7>80% [TBD-TBD]BF, p-PhC, p-DIC, Fluo0.17
460x/0.95 Air Nikon60x/0.95 Air 
Plan Apo
M25x0.75		MRD00600

100x

1.45


Air


Plan Apo0.15>80% [TBD-TBD]BBF, p-PhC, p-DIC, Fluo0.17

BF: Champ clair (Bright-field)
p-PhC: Pseudo-contraste de phase
p-DIC: Pseudo-contraste d'interférence différentiel


  • Cubes de filtres

    1. DAPI

    2. GFP

    3. Cy3

    4. Cy5

    5. Cy5.5
Développer
titleCaractéristiques complètes des filtres


PositionNomMarqueIdentifiant

Miroir polychroïque

(Transmission)

Filtre d'émissionBande passante effective
1DAPITBDTBDBP 420/20
[430-462]		455/50
[430-480]		[430-480]
2GFPTBDTBD

BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137

525/20
[515-535]		[515-535]
3Cy3TBD

TBD

BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137605/52
[579-631]		[582-618]
4

Cy5

TBD

TBD

BP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137707/72
[671-743]		[671-743]
5

Cy5.5

TBDTBDBP 446/32; 524/42; 600/36; 732/137720/60
[690-750]		[690-750]



  • Détecteur
    • sCMOS Monochrome 2560 x 2160 pixels, 16-bit, pixel 6.5um x6.5um, capteur 16.6mm x 14.0mm



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idGuide d'utilisation
titleGuide d'utilisation


UI Expand
expandedtrue
titleDémarrage

  1. Si nécessaire, allumez le du microscope (#1)

    Info
    titleNote

    L’interrupteur n’est pas facilement accessible et se trouve à l’arrière du côté droit de l’appareil


  2. Si nécessaire, allumez l’ordinateur (#2)
  3. Utilisez vos identifiants UdeM pour vous connecter à Windows

  4. Démarrez le logiciel IN Cell Analyzer 6000


UI Expand
titleMise en place

Dans le logiciel IN Cell Analyzer:

  1. Cliquez sur Eject pour ouvrir la porte d'accès
  2. Insérer votre échantillon dans l'espace prévu à cet effet en respectant l'orientation indiquée

  3. Cliquez sur Load pour fermer la porte d'accès


    Remarque
    titleImportant

    Pour une utilisation avec l'objectif 60x il est absoluement nécessaire d'utiliser une plaque multi-puit avec un fond de verre. L'épaisseur de verre doit être de 0.17mm. Nous recommandons les plaques suivantes:

    • Link in New Window
      linkTextGreiner SensoPlate
      Plus
      plus 96-well plate #655891
      hrefhttps://shop.gbo.com/en/row/products/bioscience/microplates/sensoplate-glass-bottom-plates/bs-sensoplate-plus/655891.html
    • Link in New Window
      linkTextNunc Optical CVG 96-well 164588
      hrefhttps://www.thermofisher.com/order/catalog/product/164588



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titleFermeture
  1. Récuppérez vos échantillons
  2. Cliquez sur Load pour refermer la porte d'accèsEnregistrez vos données
  3. Fermez le logiciel In Cell Analyzer
  4. Transférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C:
  5. Récuppérez vos échantillons
  6. Cliquez sur Load pour refermer la porte d'accès
  7. Éteindre l'ordinateur
Remarque
titleRappels Importants
  • Récupérez vos échantillons notamment ceux dans le microscope
  • Laissez le microscope et l’espace de travail propre



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titleGestion du stockage
  • Les fichiers peuvent être sauvés temporairement (pendant l’acquisition) sur le disque local C: (bureau)
  • À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe et supprimez-les du disque local C:
  • Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. A l’intérieur créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).
Remarque
titleImportant

Dans tous les cas, ne stockez pas vos fichiers sur le disque C:




Mesurer la hauteur

de plaque

et l'épaisseur du fond de plaque

Naviguez

Dans le logiciel IN Cell Analyzer:

  1. Cliquez sur le Dashboard
et sélectionnez
  2. Dans Objective Lens
Selectionnez
  1. selectionnez l'objectif 10x
  2. Sur le plan de la plaque cliquez sur le centre d'un puit contenant un échantillon pour centrer ce puit sur l'objectif
Sur le Dashboard  sous
  1. Dans le menu du Dashboard sélectionnez Plate/Slide
cliquez
  2. Cliquez sur Verify LAF
  3. Si les 2 pics
sont
  1. détéctés (lignes verticales bleues)
en accord avec les pics de
  1. correspondent aux pics mesurés (courbe noire)
, cliquez
    1. Cliquez sur Apply Measured Parameters
    2. Cliquez sur OK
    3. Cliquez sur Yes
  2. Si les 2 pics
ne sont pas correctement détectés, modifiez le
  1. détéctés (lignes verticales bleues) ne correspondent aux pics mesurés (courbe noire),
    1. Modifiez la valeur du bottom thickness et répétez l'opération.
  2. Fermez la fenêtre Laser Autofocus Plate/Slide Verification

Écart

Mesurer l'écart du puit A1 (Offset)

Dans le logiciel In Cell Analyzer:

Naviguez
  1. Cliquez sur le Dashboard
et sélectionnez
  2. Dans Objective Lens
Selectionnez
  1. selectionnez l'objectif 10x
Cliquez
  1. Dans la liste des canaux, cliquez sur le bouton +
pour ajouter un channel brightfield
  1. et ajoutez un canal en lumière transmise (brightfield)
  2. À droite du
Sur le
  1. plan de la plaque, cliquez
sur le centre du puit A1 pour centrer ce puit
  1. sur
l'objectifCliquez sur
  1. le bouton Setup Preview Imaging
Dessiner
  1. Dessinez un rectangle autour du puit A1
  2. Cliquez sur preview (sur le panneau d'acquisition en haut à droite de l'écran)
  3. Attendre que la prévisualisation soit générée
  4. Sur le plan de la plaque, cliquez sur le centre réel du puit A1 pour centrer ce puit sur l'objectif
Dans le dashboard

  1. Dans le menu du Dashboard sélectionnez Plate/Slide

et cliquez

  2. Cliquez sur Edit Plate puis sur Define Upper Left Well

  3. Cliquez sur Yes

  4. Vérifiez que le cercle jaune coincide avec les bords du puit

  5. Cliquez sur Yes


Distance inter-puit (Offset)

  • Répétez les étapes

1 à 11

  • du Offset pour le puit en bas à droite

Vérification

  • Générez une prévisualisation des puits en haut à gauche et en bas à droite afin de vérifier qu'ils sont biens alignés avec le plan de la plaque

  • Sauvegardez votre plaque  


UI Expand
titlePremière utilisation

Lors de la première utilisation, il est nécessaire de créer et définir le type de plaque utilisée.

Créer une nouvelle plaque

Dans le logiciel IN Cell Analyzer:

  1. Sélectionnez dans le menu Application>Plate\Slide Manager...
  2. Sélectionnez Cliquez sur l'icone New Plate\Slide
  3. Sélectionnez le numéro nombre de puits de votre plaque (6, 24, 96 etc...)
  4. Ajustez les paramètres suivants:
    1. Nom: Votre-Nom_Votre-plaque
    2. Hauteur de plaque, épaisseur du fond et volume du puit (Plate height, Bottom Thickness, well volume) habituellement fournis dans la fiche technique du produit par le manufacturier
    3. Le matériau utilisé plastique ou verre (Plastic or Glass)
    4. Si nécessaire ajustez le nombre de lignes et de colonnes ainsi que la forme du puit (rond ou rectangulaire)
  5. Cliquez sur OK
  6. Fermez la fenetre fenêtre du Plate/Slide Manager
Info
title
Info
titleL'écart de A1 (Offset) et la distance interpuit peuvent être mesurés



Tabs Page
idTrajet lumineux
titleTrajet lumineux

Les schémas suivants permettent de suivre le trajet lumineux en lumière transmise (fond clair) et en lumière réfléchie (fluorescence).



Tabs Page
idManuals
titleManuels

Manuels disponibles version anglaise.


Tabs Page
idLog
titleLog

Section disponible dans la version anglaise.


Tabs Page
idFiche Technique
titleFiche Technique


Section disponible dans la version anglaise.


Tabs Page
idDépannage et FAQ
titleDépannage et FAQ

Dépannage

UI Expand
Dépannage
expandedtrue
titleLe microscope n'affiche pas la lumière verte habituelle, que faire?

Habituellement, ce microscope affiche une lumière verte lorsqu'il est opérationel et une lumière orange lorsqu'il est en cours d'utilisation.

Une lumière rouge est allumée signifie que le microscope n'est pas fonctionnel. Dans ce cas veuillez contacter le responsable de la plateforme.


FAQ

UI Expand
FAQ
expandedtrue
titlePuis-je utiliser ce microscope pour observer des cellules en culture?
Non

Oui. Ce microscope est conçu pour l'acquisition à haut-débit de spécimen en plaques multi-puits.

Vous pouvez également faire l'acquisition d'images de specimen entre lame et lamelle (épaisseur 0.17mm)


UI Expand
expandedtrue
titleComment éteindre le microscope?

Habituellement le microscope reste allumé. Cependant, il est préférable de l'éteindre en cas de non-utilisation prolongée. Pour ce faire:

  1. Naviguez dans le menu Application> Hardware>
  2. Cliquez sur Shutdown Instrument
  3. Attendre que le microscope s'éteigne
  4. Le logiciel se ferme automatiquement





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idDemo Image
titleInCell Analyzer
directionhorizontal


Tabs Page
idImage de démonstration
titleImage de démonstration



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Plateformes:_foot
Plateformes:_foot