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id | Description |
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title | Description |
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| Microscope confocal à disque rotatif Zeiss Axio-Observer Z1Pavillon J-A Bombardier, Local 3223-11 Tarif d'utilisation utilisation Microscope Avancé tier 2
Instrument octroyé au Dr Daniel Zenklusen par la Fondation Canadienne pour l'Innovation (FCI)
Info |
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title | Applications principales |
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| - Lumière transmise
- Fluorescence
- Imagerie du vivant
- Incubateur (Temperature & CO2)
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title | Spécifiations complètes de la Lumencor SOLA |
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| Emission peak (nm) | Power (mW) | 334 | 5 | 365 | 20 | 405 | 19 | 436 | 22 | 546 | 21 | 579 | 18 |
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title | Caractéristiques complètes des sources |
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| lumineuses | Laser (nm) | Puissance nominale (mW) | Puissance |
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| à objectif 10xéchantillon (Obj. 10x; 02/07/2024) |
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405 | 50 | 0.7 | 488 | 100 | 3.3 | 561 | 50 | 2.3 | 631 | 50 | 1.1 |
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| 405 | 488 | 561 | 631 | - Objectifs
- 100x/1.46 Oil WD 0.11
- TIRF Divergence adjusting aid
- TIRF Angle adjusting aid
- 63x/1.46 Oil WD 0.1
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title | Caractéristiques complètes des objectifs |
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| Position | Nom | Marque | Nom complet | Identifiant | Grossissement | Ouverture numérique | Immersion | Type | Distance de travail (mm) | Transmittance (% [nm]) | Technique | Épaisseur du couvre-objet (mm) | 1 | 100x/1.46 Oil | Zeiss | 100x/1.46 DIC I Alpha Plan-ApoChromat M27 | 420792-9800 | 100x | 1.46 | Oil | Plan Apochromat | 0.11 |
Wiki Markup |
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{+}>70% \[410-800\]+ |
| BF, DIC, Fluo | 0.17 | 2 | TIRF Divergence adjusting aid | Zeiss |
| 423682-8801-000 |
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| 3 | TIRF Angle adjusting aid | Zeiss |
| 423682-8802-000 |
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| 4 | 63x/1.46 Oil | Zeiss | 63x/1.46 DIC III Alpha Plan-Apochromat Korr TIRF M27 | 420780-9970-000 | 63x | 1.46 | Huile | Plan Apochromat | 0.10 |
Wiki Markup |
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{+}>80% \[500-800\]+ |
| BF, DIC, Fluo | 0.15-0.19 | 5 | 10x/0.3 Air | Zeiss | 10x/0.3 EC Plan-NeoFluar | 420340-9901 | 10x | 0.3 | Air | Plan-NeoFluar | 5.2 |
Wiki Markup |
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{+}>90% \[450-750\]+ |
| BF, DIC, Fluo | 0.17 | 6 | Empty |
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BF: | Champ clair ()PhC : Contraste de phaseDIC: Interference contrast |
Cubes de filtres- Empty
- BS_455
- LSM TFT80/20 1447-381
- BF RL TIRF Calibration 424928
- Set 76 C/G/Dr
- Set 77 G/R/A6
- DAPI
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title | Caractéristiques complètes des filtres |
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| Position | Nom | Marque | Identifiant | Filtre d'excitation | Miroir dichroïque | Filtre d'émission | Commentaires |
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1 | DAPI Filter Set 49 | Zeiss | 488049-9901 | 365/50 [325-375] | 395LP | 445/50 [420-470] |
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id | Guide d'utilisation |
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title | Guide d'utilisation |
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UI Expand |
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expanded | true |
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title | Démarrage |
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| - Allumez l’ordinateur (#1)
- Si nécessaire, allumez la multiprise d’alimentation du module d'incubation
- Allumez la multiprise d’alimentation des cameras (#2), à gauche du microscope sur le module des lasers
- Allumez la multiprise d’alimentation du microscope (#3), à droite du microscope
Utilisez vos identifiants UdM pour vous connecter à Windows
Note |
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Lors de la première utilisation il est nécessaire d’importer les paramètres du microscope AVANT de démarrer le logiciel. Pour ce faire, suivre les instructions Première Utilisation. |
Démarrez le logiciel Zen Blue
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UI Expand |
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title | Première Utilisation |
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| Lors de la première utilisation, il est nécessaire d’importer dans le logiciel les paramètres spécifiques au microscope. Cette procédure est habituellement réalisée lors de la séance de formation. Il est cependant également possible de l’utiliser pour réinitialiser le logiciel si celui-ci ne s‘affiche pas correctement par exemple. Note |
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Attention, cette procédure supprimera tous vos protocoles d’expérience et rétablira les paramètres originaux du logiciel. |
- Si ouvert, fermez le logiciel Zen Blue et attendre sa fermeture complète (jusqu’à 30 secondes)
- Sur le Bureau ouvrez le dossier Documentation
- Double-cliquez sur Settings for Axio-Observer Z1
- Un script s'excutera et une fenêtre noire apparaitra brièvement
- Vous pouvez ensuite réouvrir le logiciel Zen Blue
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UI Expand |
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title | Chargement des échantillons |
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| Cette procédure permet de mettre le microscope dans une configuration sécuritaire et d'effectuer une calibration de la mise au point. À la fin de cette procédure le microscope sera prêt pour l'acquisition.
UI Expand |
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title | Calibration de la mise au point (Z) |
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| Sur l’écran tactile du microscope : - Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basse
- Appuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette position
- Si nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactile
- Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives>10x pour sélectionner l'objectif 10x
- Si demandé, appuyez sur Done pour supprimer l'avertissement de nettoyage de l'objectif à huile
- Appuyez sur Home>Microscope>XYZ>Position>Z-Position>Set zero>Auto pour effectuer la calibration de la mise au point
- Appuyez sur OK pour lancer la procédure de calibration de la mise au point
- Attendre quelques secondes que la calibration soit terminée
Note |
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Si calibrée, la mise au point est aux alentours de Z = 5 mm). La valeur de la position en Z est visible sur l'écran tactile Home>Z-Position |
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UI Expand |
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title | Première mise au point |
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Warning |
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Faire d’abord la calibration de la mise au point avant d'effectuer la première mise au point. |
Sur l’écran tactile du microscope : - Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives
Appuyez sur 10x pour sélectionner l'objectif 10x
Info |
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L’objectif 10x est le plus sécuritaire car il possède une grande distance de travail (6.5 mm). L'échantillon apparaitra parfaitement net bien avant que l'objectif ne s'approche de celui-ci. Il est recommandé de toujours faire la première mise au point avec un objectif sécuritaire. Les objectifs sont para-focaux, faire la mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire vous permettra ensuite de trouver facilement votre échantillon avec un autre objectif. |
- Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basse
- Appuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette position
- Si nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactile
Placez la lame de test sur la platine du microscope avec le couvre-objet vers l'objectif
Note |
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Toujours utiliser la lame de test pour effectuer la première mise au point. |
- Si nécessaire, déplacez la platine pour que l'échantillon soit centré sur l'objectif
Sur l’ordinateur : Ouvrez le logiciel Zen Blue Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (CFP/GFP/DsRed ou GFP/RFP/Cy5, etc…) pour activer la configuration Ajustez la mise au point avec la molette principale tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette Note |
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Si calibrée, la mise au point est aux alentours de Z = 5 mm). La valeur de la position en Z est visible sur l'écran tactile Home>Z-Position |
- Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination
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UI Expand |
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title | Mise au point secondaire |
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Warning |
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Faire d’abord la première mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire avant de sélectionner un autre objectif et de poursuivre avec la mise au point secondaire. |
UI Expand |
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title | Mise au point avec les objectifs à air |
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| Ce microscope ne possède pas d'autres objectifs à air que le 10x. Cependant s'il en avait la procédure serait la suivante:: Après avoir effectué la première mise au point, sur l’écran tactile du microscope : Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives Appuyez sur l'objectif désiré
Dans le logiciel Zen Blue : - Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (CFP/GFP/DsRed ou GFP/RFP/Cy5, etc…) pour activer la configuration
- Ajustez la mise au point avec la molette de précision tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette
- Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination
- Votre échantillon est prêt pour l’acquisition !
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UI Expand |
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title | Mise au point avec les objectifs à l'huile |
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| Après avoir effectué la première mise au point, sur l’écran tactile du microscope : Appuyez sur Home>Microscope>Control>Objectives Appuyez sur l'objectif désiré 63x ou 100x. Le microscope abaissera automatiquement la platine pour que l'échantillon soit accessible.
Info |
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L’objectif 63x est le meilleur objectif à huile car il possède le plus grand nombre de corrections optiques (Plan Apochromat) et la plus grande ouverture numérique (1.4). Il offre une résolution latérale de 420nm à une longueur d'onde de 550nm. |
- Retirez votre échantillon
- Déposer une goutte d’huile sur l'objectif
- Replacez votre échantillon
- Appuyez sur Done. Le microscope replacera automatiquement l'échantillon à sa position originale.
Dans le logiciel Zen Blue : - Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (CFP/GFP/DsRed ou GFP/RFP/Cy5, etc…) pour activer la configuration
- Ajustez la mise au point avec la molette de précision tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette
- Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination
- Votre échantillon est prêt pour l’acquisition !
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UI Expand |
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| - Les fichiers peuvent être sauvés temporairement (pendant l’acquisition) sur le disque local C: (bureau)
- À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe et supprimez-les du disque local C:
- Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. À l’intérieur, créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).
Note |
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Dans tous les cas, ne stockez pas vos fichiers sur le disque C: |
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UI Expand |
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| - Enregistrez vos données
- Fermez le logiciel Zen Blue
- Transférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C:
- Si utilisée, éteindre la multiprise d’alimentation du module d'incubation
- Si utilisés, nettoyez les objectifs à huile avec du nettoyant et du papier à lentille
- Éteindre la barre d’alimentation du microscope (#3)
- Éteindre la barre d’alimentation des cameras (#2)
- Éteindre l'ordinateur
Note |
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| - Récupérez vos échantillons notamment ceux dans le microscope
- Laissez le microscope et l’espace de travail propre
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id | Trajet lumineux |
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title | Trajet lumineux |
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| Les schémas suivants permettent de suivre le trajet lumineux en lumière transmise (fond clair, contraste de phase) et en lumière réfléchie (fluorescence). |
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| Manuels disponibles version anglaise. |
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id | Dépannage et FAQ |
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title | Dépannage et FAQ |
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| Dépannage UI Expand |
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expanded | true |
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title | Je ne vois pas mon échantillon |
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| Le spinning disk est un confocal multipoints. En dehors du plan focal l'échantillon disparait complètement. Il est donc plus facile de trouver son échantillon aux occulaires. Suivre la procédure de mise au point pour y parvenir. |
FAQ UI Expand |
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title | Puis-je utiliser ce microscope pour observer des cellules en culture? |
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| Oui. C'est un microscope inversé conçu pour l'observation de spécimen vivant. Le spining disk est particulièrement apprécié pour sa phototoxicité limitée. |
Plus de dépannage et de FAQs sont disponibles dans la version anglaise. |
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