Tabs Page |
---|
id | Description |
---|
title | Description |
---|
| Microscope inversé Zeiss Axio-Observer Z1Pavillon Roger Gaudry, Local R-421
Accès sur demande auprès de la responsable de la Plateforme de microscopie du département de Pharmacologie et Physiologie. Consultez les Link in New Window |
---|
icon | false |
---|
linkText | tarifs |
---|
href | https://pharmacologie-physiologie.umontreal.ca/wp-content/uploads/sites/38/2017/05/tarification-2017.pdf |
---|
target | _blank |
---|
| et la Link in New Window |
---|
icon | false |
---|
linkText | politique d'accès |
---|
href | https://pharmacologie-physiologie.umontreal.ca/ressources/plateforme-de-microscopie/politique-dacces/ |
---|
target | _blank |
---|
| de la Link in New Window |
---|
icon | false |
---|
linkText | Plateforme de Microscopie du département de Pharmacologie et Physiologie |
---|
href | https://pharmacologie-physiologie.umontreal.ca/ressources/plateforme-de-microscopie/ |
---|
target | _blank |
---|
|
Tarif d'utilisation Microscope Simple
Instrument octroyé aux Dre Audrey Claing et Dr Jean-Philippe Gratton par la Fondation Canadienne pour l'Innovation (FCI) - Applications
- Lumière transmise
- Contraste de phase
- Fluorescence
Sources lumineuses lampe X-Citesource lumineuse Colibri 7 de Zeiss |
| Pic d'émission (nm) | Puissance (mW) |
---|
|
33473654540534436 | 43 | 546 | 37 | 579 | 26 | Brochure X-Cite 120Q (anglais pdf) Guide de démarrage rapide X-Cite 120Q (anglais pdf) Manuel d'utilisateur X-Cite 120Q (anglais pdf) Comparaison entre les spectres d'émission de lampe au mercure HBO vs X-Cite (anglais) (Source)
Objectifs 2.5x/0.085 Air WD 8.8 - Vide
10x/0.25 Air Ph1 WD 6.5 - Vide
- 20x/0.5 Air Ph2 WD 2.0
- 40x/0.95 Air WD 0.25
Expand |
---|
title | Caractéristiques complètes des objectifs |
---|
|
Position | Nom | Marque | Nom complet | Identifiant | Grossissement | Ouverture numérique | Immersion | Type | Distance de travail (mm) | Transmittance (% [nm]) | Technique | Épaisseur du couvre-objet (mm) |
---|
1 | 20x/0.5 Air | Zeiss | 20x/0.50 Ph2 EC Plan-Neofluar M27 | 420351-9910 | 20x |
|
2050 | Air | Plan Neofluar | 2.0 | Not Available | BF, PhC, Fluo | 0.17 | 2 | Vide |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 3 | | Zeiss | 40x/0.95 Plan-Apochromat Corr M27 | 420660-9970 | 40x | 0.95 | | Plan ApoChromat | 0.25 | >80% [400-840] | BF, Fluo | 0.13 - 0.21 Bague d'ajustement | 4 | Vide |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 5 | 2.5x/0.085 Air | Zeiss | 2.5x/0.085 EC Plan-Neofluar M27 | 420320-9902 | 2.5x | 0.085 | Air | Plan Neofluar | 8.8 | >95% [400-750] | BF, Fluo | 0.17 | 6 | 10x/0.25 Air | Zeiss | 10x/0.25 Ph1 N-Achroplan M27 | 420941-9911 | 10x | 0.25 | Air | AchroPlan | 6.5 | Not available | BF, PhC, Fluo | 0.17 |
BF : Champ clair (Bright-field) PhC : Contraste de phase
|
- Cubes de filtres
- DAPI
- GFP
- Rhodamine
- DHE (dihydroethidium)
- Cy5
- Quadruple DAPI/GFP/Cy3/Cy5
Expand |
---|
title | Caractéristiques complètes des filtres |
---|
|
|
VideQuadruple DAPI/GFP/Cy3/Cy5 | Zeiss | 489090-9110-000 |
| QBS 405 + 493 + 575 + 653 | QBP 425/30+514/30+592/25+709/100 | Filtres d'excitation inclus dans la source lumineuse |
|
- Détecteur
- Caméra CCD Zeiss AxioCam MR R3 1388 x 1040 pixels,12-bit, 13 images/s à pleine résolution, taille du capteur 8.9 mm x 6.7 mm 1388 x 1040mm
Tabs Page |
---|
id | Guide d'utilisation |
---|
title | Guide d'utilisation |
---|
| UI Expand |
---|
expanded | true |
---|
title | Démarrage |
---|
| - Retirez la housse de protection du microscope
- Allumez l’ordinateur (#1)
- Si nécessaire, allumez la multiprise d’alimentation du module d'incubation (#2A) et ouvrir la bonbonne de CO2 (#2B)
- Allumez la multiprise d’alimentation du microscope (#2#3)
- Appuyez sur le bouton de démarrage du microscope situé à l'arrière gauche (#3)#4)
Si la fluorescence est nécessaire, allumez la lampe X-Cite (#4A) et ouvrir le diaphragme (#4B) Warning |
---|
La lampe X-Cite doit être allumée pendant au moins 30 minutes avant d’être éteinte et vice-versa |
Utilisez vos identifiants UdM pour vous connecter à Windows
Démarrez le logiciel Zen Blue
Infonote |
---|
Lors de la première utilisation, il est nécessaire d’importer les paramètres du microscope dans AVANT de démarrer le logiciel. Pour ce faire, suivre les instructions Paramétrage du logiciel. Première Utilisation. |
Démarrez le logiciel Zen
|
UI Expand |
---|
title | Fermeture | | Première Utilisation |
---|
| Lors de la première utilisation, il est nécessaire d’importer dans le logiciel les paramètres spécifiques au microscope. Cette procédure est habituellement réalisée lors de la séance de formation. Il est cependant également possible de l’utiliser pour réinitialiser le logiciel si celui-ci ne s‘affiche pas correctement par exemple. Note |
---|
Attention, cette procédure supprimera tous vos protocoles d’expérience et rétablira les paramètres originaux du logiciel. |
- Si ouvert, fermez le logiciel Zen Blue et attendre sa fermeture complète (jusqu’à 30 secondes)
- Sur le Bureau ouvrez le dossier Documentation
- Double-cliquez sur Settings for Axio-Observer Z1
- Un script s'excutera et une fenêtre noire apparaitra brièvement
- Vous pouvez ensuite réouvrir le logiciel Zen
|
UI Expand |
---|
title | Chargement des échantillons |
---|
| Cette procédure permet de mettre le microscope dans une configuration sécuritaire et d'effectuer une calibration de la mise au point. À la fin de cette procédure le microscope sera prêt pour l'acquisition. UI Expand |
---|
title | Calibration de la mise au point (Z) |
---|
| Sur l’écran tactile du microscope : - Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basse
- Appuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette position
- Si nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactile
- Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives>10x pour sélectionner l'objectif 10x
- Si demandé, appuyez sur Done pour supprimer l'avertissement de nettoyage de l'objectif à huile
- Appuyez sur Home>Microscope>XYZ>Position>Z-Position>Set zero>Auto pour effectuer la calibration de la mise au point
- Appuyez sur OK pour lancer la procédure de calibration de la mise au point
- Attendre quelques secondes que la calibration soit terminée
Note |
---|
Si calibrée, la mise au point est aux alentours de Z = 1.5 mm). La valeur de la position en Z est visible sur l'écran tactile Home>Z-Position |
|
UI Expand |
---|
title | Première mise au point |
---|
| Warning |
---|
| Faire d’abord la calibration de la mise au point avant d'effectuer la première mise au point. |
Sur l’écran tactile du microscope : - Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives
Appuyez sur 10x pour sélectionner l'objectif 10x
Info |
---|
L’objectif 10x est le plus sécuritaire car il possède une grande distance de travail (6.5 mm). L'échantillon apparaitra parfaitement net bien avant que l'objectif ne s'approche de celui-ci. Il est recommandé de toujours faire la première mise au point avec un objectif sécuritaire. Les objectifs sont para-focaux, faire la mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire vous permettra ensuite de trouver facilement votre échantillon avec un autre objectif. |
- Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basse
- Appuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette position
- Si nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactile
Placez la lame de test sur la platine du microscope avec le couvre-objet vers l'objectif
Note |
---|
| Toujours utiliser la lame de test pour effectuer la première mise au point. |
- Si nécessaire, déplacez la platine pour que l'échantillon soit centré sur l'objectif
Sur l’ordinateur : Ouvrez le logiciel Zen Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (DAPI, GFP, Rhodamine, etc…) pour activer la configuration Ajustez la mise au point avec la molette principale tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette Note |
---|
Si calibrée, la mise au point est aux alentours de Z = 1.47 mm). La valeur de la position en Z est visible sur l'écran tactile Home>Z-Position |
- Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination
|
UI Expand |
---|
title | Mise au point secondaire |
---|
| Warning |
---|
| Faire d’abord la première mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire avant de sélectionner un autre objectif et de poursuivre avec la mise au point secondaire. |
UI Expand |
---|
title | Mise au point avec les objectifs à air |
---|
| Après avoir effectué la première mise au point, sur l’écran tactile du microscope : Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives Appuyez sur 20x ou 40x pour sélectionner l'objectif désiré Info |
---|
L’objectif 40x est le meilleur objectif à Air car il possède le plus grand nombre de corrections optiques (Plan Apochromat) et la plus grande ouverture numérique (0.95). Il offre une résolution latérale de 420nm à une longueur d'onde de 550nm. |
- Ajustez la mise au point avec la molette de précision tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette
- Votre échantillon est prêt pour l’acquisition !
|
UI Expand |
---|
title | Mise au point avec les objectifs à l'huile |
---|
| Ce microscope ne possède pas d'objectifs à immersion à l'huile. Cependant s'il en avait la procédure serait la suivante: Après avoir effectué la première mise au point, sur l’écran tactile du microscope : Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives Appuyez sur l'objectif désiré. Le microscope abaissera automatiquement la platine pour que l'échantillon soit accessible. - Déposer une goutte d’huile sur votre échantillon
- Appuyez sur Done. Le microscope replacera automatiquement l'échantillon à sa position originale.
Dans le logiciel Zen : - Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (GFP, Rhodamine, DAPI, etc…) pour activer la configuration
- Ajustez la mise au point avec la molette de précision tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette
- Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination
- Votre échantillon est prêt pour l’acquisition !
|
| Enregistrez vos donnéesFermez le logiciel Zen BlueTransférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C:Éteindre l'ordinateurSi la fluorescence a été utilisée, éteindre la lampe X-Cite (#4A) Warning |
---|
La lampe X-Cite doit être allumée pendant au moins 30 minutes avant d’être éteinte et vice-versa | Éteindre la multiprise d’alimentation du microscope (#2)Couvrir l’instrument avec la housse de protection Note |
---|
| Récupérez vos échantillons notamment ceux dans le microscopeLaissez le microscope et l’espace de travail propre |
|
UI Expand |
---|
| - Les fichiers peuvent être sauvés sauvés temporairement (pendant l’acquisition) sur le disque local C: (bureau)
- À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe et supprimez-les du disque local C:
- Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. À l’intérieur, créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).
Note |
---|
Dans tous les cas, ne stockez pas vos fichiers sur le disque C: |
|
UI Expand |
---|
title | Paramétrage du logiciel | Fermeture |
---|
| - Enregistrez vos données
- Fermez le logiciel Zen
- Transférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C:
- Si utilisé, éteindre la multiprise d’alimentation du module d'incubation (#2A) et fermez la bonbonne de CO2 (#2B)
- Sélectionner l'objectif 10x et remettre les objectifs en position basse (Load position)
- Éteindre la barre d’alimentation du microscope (#3)
- Éteindre l'ordinateur
- Couvrir l’instrument avec la housse de protection
Note |
---|
| - Récupérez vos échantillons notamment ceux dans le microscope
- Laissez le microscope et l’espace de travail propre
|
Lors de la première utilisation, il est nécessaire d’importer dans le logiciel les paramètres spécifiques au microscope. Cette procédure est habituellement réalisée lors de la séance de formation. Il est cependant également possible de l’utiliser pour réinitialiser le logiciel si celui-ci ne s‘affiche pas correctement par exemple. Note |
---|
Attention, cette procédure supprimera tous vos protocoles d’expérience et rétablira les paramètres originaux du logiciel. | Si ouvert, fermez le logiciel Zen Blue et attendre sa fermeture complète (jusqu’à 30 secondes)Sur le Bureau ouvrez le dossier DocumentationDouble-cliquez sur Zen Settings for Axio-Observer Z1Vous pouvez ensuite réouvrir le logiciel Zen Blue |
|
Tabs Page |
---|
id | Trajet lumineux |
---|
title | Trajet lumineux |
---|
| Les schémas suivants permettent de suivre le trajet lumineux en lumière transmise (fond clair, contraste de phase) et en lumière réfléchie (fluorescence). PDF |
---|
| name | LightPath_Zeiss_Z1.pdf View file |
---|
name | LightPath_Zeiss_Z1.pdf |
---|
height |
---|
| 400
---|
Tabs Page |
---|
id | Fiche Technique |
---|
title | Fiche Technique |
---|
| Section disponible dans la la version anglaise. |
Tabs Page |
---|
id | Dépannage et FAQ |
---|
title | Dépannage et FAQ |
---|
| Dépannage UI Expand |
---|
title | Je ne vois pas de fluorescence ! | L'image en fluorescence n'apparait pas comme d'habitude (fond clair) |
---|
| Il est possible que la lumière utilisée pour l'excitation de fluorescence se reflète dans la LED de la lumière transmise. Cela se traduit par un bruit de fond en fluorescence. Le fond apparait au lieu d'être noir. Pour résoudre ce problème il y a plusieurs options: - Fermer le diaphragme de champ
- Relever le bras de l'illumination de la lumière transmise
- Ajouter un cache pour couvrir l'échantillon
Ce microscope est motorisé pour la majeure partie de ses composants, cependant la source lumineuse X-Cite est manuelle. Il est donc important de vérifier que le diaphragme sur la lampe X-Cite (#4B) est ouvert (position haute). Sur la lampe X-CiteTournez le diaphragme de contrôle de l'intensité (#4B) vers le haut |
FAQ UI Expand |
---|
title | Puis-je utiliser ce microscope pour observer des cellules en culture? |
---|
| Oui. C'est un microscope inversé conçu pour l'observation de spécimen en cultures. Les objectifs sont optimisés pour observer au travers de plaques multi-puits à fond de verre. Il est également possible d'observer des échantillons entre lame et lamelles (d'épaisseur 0.17mm). |
UI Expand |
---|
title | Puis-je utiliser ce microscope pour réaliser des timelapse? |
---|
| Oui, mais... Ce microscope possède un module d'incubation permettant le maintien de la température et de l'atmosphère. Cependant, il ne possède pas de module permettant le maintien du plan focal dans le temps (Definite Focus). Il est possible que la mise au point ne soit pas aussi bonne lors de longues experiences. |
Plus de dépannage et de FAQs sont disponibles dans la version anglaise. |
|