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id | Description |
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title | Description |
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| Microscope droit Zeiss Axio-Imager Z2Pavillon Roger GaudryJ-A Bombardier, Local B-301-1 Accès sur demande auprès de la responsable de la Plateforme de microscopie du département de Biochimie et Médecine Moléculaire. Consultez les Link in New Window |
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icon | false |
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linkText | tarifs |
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href | https://biochimie.umontreal.ca/wp-content/uploads/sites/37/2021/02/Tarifs_2021-22_pour_utilisation_des_plateformes_BMM.pdf |
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target | _blank |
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| et la Link in New Window |
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icon | false |
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linkText | politique d'accès |
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href | https://biochimie.umontreal.ca/wp-content/uploads/sites/37/2021/10/Reglements.pdf |
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target | _blank |
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| de la Plateforme de Microscopie du département de Biochimie et Médecine Moléculaire. 3223-0 Tarif d'utilisation Microscope Avancé tier 1
Instrument octroyé au Dr Pascal Chartrand par la Fondation Canadienne pour l'Innovation (FCI) Applications Sources lumineuses Objectifs 10x/0.30 Air WD 5.30 20x/0.80 Air WD 0.61 40x/0.75 Air WD 0.71 63x/1.40 Huile WD 0.19 100x/1.30 Huile WD 0.20 100x/1.40 Huile WD 0.17
Expand |
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title | Caractéristiques complètes des objectifs |
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Position | Nom | Marque | Nom complet | Identifiant | Grossissement | Ouverture numérique | Immersion | Type | Distance de travail (mm) | Transmittance (% [nm]) | Technique | Épaisseur du couvre-objet (mm) |
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1 | 10x/0.30 Air | Zeiss | 10x/0.3 DIC I EC Plan-Neo Fluar M27 | 420340-9901-000 | 10x | 0.3 | Air | Plan Neofluar | 5.2 | >90% [480-780] | BF, DIC, Fluo | 0.17 | 2 | 20x/0.80 Air | Zeiss | 20x/0.8 DIC II Plan-Apochromat W0.8x1/36" | 440640-9903-000 | 20x | 0.8 | Air | Plan Apochromat | 0.55 | >90% [410-800] | BF, DIC, Fluo | 0.17 | 3 |
40x/0.75 Air
| Zeiss | 40x/0.75 DIC II EC Plan-Neofluar M27 | 420360-9900-000 | 40x | 0.75 |
Air
| Plan Neofluar | 0.71 | >90% [410 |
|
- Applications
- Lumière transmise
- Contraste d'interférecence (DIC)
- Fluorescence
Sources lumineuses Lampe halogène 12V 100W pour la lumière transmise Lampe X-Cite exacte 200 W (340~675nm) pour la fluorescence Expand |
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title | Caractéristiques complètes de la lampe X-Cite exacte |
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| Pic d'émission (nm) | Puissance (mW) |
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334 | 5 | 365 | 20 | 405 | 19 | 436 | 22 | 546 | 21 | 579 | 18 | Guide de démarrage rapide X-Cite exacte (anglais pdf) Guide d'utilisation X-Cite exacte (anglais pdf) Comparaison entre les spectres d'émission de lampe au mercure HBO vs X-Cite exacte (anglais) (Source)
Objectifs 10x/0.30 Air WD 5.30 20x/0.80 Air WD 0.61 - 40x/0.75 Air WD 0.71
63x/1.40 Huile WD 0.19 - 100x/1.30 Huile WD 0.20
100x/1.40 Huile WD 0.17
Expand |
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title | Caractéristiques complètes des objectifs |
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| Position | Nom | Marque | Nom complet | Identifiant | Grossissement | Ouverture numérique | Immersion | Type | Distance de travail (mm) | Transmittance (% [nm]) | Technique | Épaisseur du couvre-objet (mm) |
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1 | 10x/0.30 Air | Zeiss | 10x/0.3 DIC I EC Plan-Neo Fluar M27 | 420340-9901-000 | 10x | 0.3 | Air | Plan Neofluar | 5.2 | >90% [480 -780] | BF, DIC, Fluo | 0.17 | 2 4 | 20x63x/01.8040Air Huile | Zeiss | 20x 63x/ 01. 8 4 DIC IIIII Plan-Apochromat W0.8x1/36"M27 | 420782-9900 440640-9903-000 | 20x 63x | 01.84 |
Air
| Plan Apochromat | 0. 5519 | >90% >80% [ 410440- 800710] | BF, DIC, Fluo | 0.17 | 3 5 | 40x 100x/ 01. 7530
AirHuile
| Zeiss | 40x 100x/ 01. 75 3 DIC IIIII EC Plan-Neofluar M27
| 420360 420490-9900-000 | 40x100x | 0 1. 753 |
Air
| Plan Neofluar | 0. 7120 | >90% >80% [ 410400- 780820] | BF, DIC, Fluo | 0.17 | 4 6 | 63x 100x/1.40 Huile
| Zeiss | 63x 100x/1. 4 4 DIC III Plan-Apochromat M27
| 420782 420792-9900-000 | 63x100x | 1.4 |
| Plan Apochromat | 0. 1917 | >80% [ 440400- 710820] | BF, DIC, Fluo | 0.17 | 5 | 100x/1.30 Huile
| Zeiss | 100x/1.3 DIC III EC Plan-Neofluar M27
| 420490-9900-000 | 100x | 1.3 | Plan Neofluar | 0.20 | >80% [400-820] | BF, DIC, Fluo | 0.17 | 6 | 100x/1.40 Huile
| Zeiss | 100x/1.4 DIC III Plan-Apochromat M27
| 420792-9900-000 | 100x | 1.4 | Plan Apochromat | 0.17 | >80% [400-820] | BF, DIC, Fluo | 0.17 |
BF : Champ clair (Bright-field) DIC: Contraste d'interférence
|
Cubes de filtres- DAPI
- GFP
- YFP
- DsRed
- TxRed
- Cy3.0
- Cy3.5
- Cy5
- Analyseur DIC
Vide Expand |
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title | Caractéristiques complètes des filtres |
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| Position | Nom | Marque | Identifiant | Filtre d'excitation | Miroir dichroïque | Filtre d'émission | Commentaire | 1 | DAPI Filter Set 49 | Zeiss | 488049-9901-000 | 365/50 [340-390] | 395LP | 445/50 [420-470] | 2 | GFP Filter Set 38 | Zeiss | 000000-1031-346 | 470/40 [450-490] | 495LP | 525/50 [500-550] | FT 495 | BP 525/50 | 3 | YFP Filter Set 46 | Zeiss | 000000-1196-681 | 500/20 [490-510] | 515LP | 535/30 [520-550] | 4 | DsRed Filter Set 43 | Zeiss | 000000-1114-101 | 545/25 [533-557] | 570LP | 605/70 [570-640] | FT 570 | BP 605/70 | 5 | TxRed Filter Set 45 | Zeiss | 000000-1114-462 | 560/40 [540-580] | 585LP | 630/75 [593-667] | 6 | Cy3.0
Chroma | SP102v1 | 546/11 [541-551] | 557LP | 567/15 [560-574] | 7 | Cy3.5
Chroma | SP103v1 | 581/10 [576-586] | 593LP | 617/40 [597-637] | 8 | Cy5 narrow | Chroma | 49009 | 640/30 [625-655] | 660LP | 690/50 [665-715] | 9 | Analyseur DIC | Zeiss | 10 | Vide | - Détecteur
- Caméra monochrome sCMOS Photometrics Prime 2048 x 2048 pixels, 16-bit, 30 images/s à pleine résolution
BF : Champ clair (Bright-field) DIC: Contraste d'interférence
|
Cubes de filtres DAPI GFP YFP DsRed/Cy3 TxRed Cy3.0 Cy3.5 Cy5 Analyseur DIC Vide Expand |
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title | Caractéristiques complètes des filtres |
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id | Guide d'utilisation |
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title | Guide d'utilisation |
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| UI Expand |
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expanded | true |
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title | Démarrage |
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| Retirez la housse de protection du microscope Allumez l'ordinateur (#1) Allumez la lampe X-Cite exacte sur l'étagère à gauche du microscope (#2)
Info |
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L'affichage de la lampe X-Cite exacte clignotera pendant le chauffage (4 minutes environ) et sera ensuite opérationelle. |
Warning |
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La lampe X-Cite exacte doit être allumée pendant au moins 30 minutes avant d’être éteinte et vice-versa |
Allumez la barre d'alimentation sur l'étagère au dessus de l'ordinateur (#3) Appuyez sur le bouton de démarrage du microscope situé à l'arrière gauche (#4) Utilisez vos identifiants UdM pour vous connecter à Windows
Note |
---|
Lors de la première utilisation il est nécessaire d’importer les paramètres du microscope AVANT de démarrer le logiciel. Pour ce faire, suivre les instructions Première Utilisation.
|
Démarrez le logiciel Zen Blue
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UI Expand |
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title | Première Utilisation |
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| Lors de la première utilisation, il est nécessaire d’importer dans le logiciel les paramètres spécifiques au microscope. Cette procédure est habituellement réalisée lors de la séance de formation. Il est cependant également possible de l’utiliser pour réinitialiser le logiciel si celui-ci ne s‘affiche pas correctement par exemple. Note |
---|
Attention, cette procédure supprimera tous vos protocoles d’expérience et rétablira les paramètres originaux du logiciel. |
Si ouvert, fermez le logiciel Zen Blue et attendre sa fermeture complète (jusqu’à 30 secondes) Sur le Bureau ouvrez le dossier Documentation Double-cliquez sur Settings for Axio-Imager Z2 Un script s'excutera et une fenêtre noire apparaitra brièvement Vous pouvez ensuite réouvrir le logiciel Zen Blue
|
UI Expand |
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title | Chargement des échantillons |
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| Cette procédure permet de mettre le microscope dans une configuration sécuritaire et d'effectuer une calibration de la mise au point. À la fin de cette procédure le microscope sera prêt pour l'acquisition.
UI Expand |
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title | Calibration de la mise au point (Z) |
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| Sur l’écran tactile du microscope : Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basse Appuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette position Si nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactile Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives>10x pour sélectionner l'objectif 10x Si demandé, appuyez sur Done pour supprimer l'avertissement de nettoyage de l'objectif à huile Appuyez sur Home>Microscope>XYZ>Position>Z-Position>Set zero>Auto pour effectuer la calibration de la mise au point Appuyez sur OK pour lancer la procédure de calibration de la mise au point Attendre quelques secondes que la calibration soit terminée
Note |
---|
Si calibrée, la mise au point est aux alentours de Z = 11 mm). La valeur de la position en Z est visible sur l'écran tactile Home>Z-Position |
|
UI Expand |
---|
title | Première mise au point |
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| Warning |
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| Faire d’abord la calibration de la mise au point avant d'effectuer la première mise au point. |
Sur l’écran tactile du microscope : Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives Appuyez sur 10x pour sélectionner l'objectif 10x
Info |
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L’objectif 10x est le plus sécuritaire car il possède la plus grande distance de travail (5.3 mm). L'échantillon apparaitra parfaitement net bien avant que l'objectif ne s'approche de celui-ci. Il est recommandé de toujours faire la première mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire. Les objectifs sont para-focaux, faire la mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire vous permettra ensuite de trouver facilement votre échantillon avec un autre objectif. |
Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basse Appuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette position Si nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactile Placez la lame de test sur la platine du microscope avec le couvre-objet vers l'objectif
Note |
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| Toujours utiliser la lame de test pour effectuer la première mise au point. |
Si nécessaire, déplacez la platine pour que l'échantillon soit centré sur l'objectif
Sur l’ordinateur : Ouvrez le logiciel Zen Blue Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (GFP, DsRed, DAPI, etc…) pour activer la configuration Ajustez la mise au point avec la molette principale tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette Note |
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Si calibrée, la mise au point est aux alentours de Z = 11 mm). La valeur de la position en Z est visible sur l'écran tactile Home>Z-Position |
Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination
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UI Expand |
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title | Mise au point secondaire |
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|
Warning |
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| Faire d’abord la première |
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| Tabs Page |
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id | Guide d'utilisation |
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title | Guide d'utilisation |
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| UI Expand |
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expanded | true |
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title | Démarrage |
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| Si la fluorescence est nécessaire, allumez la lampe X-Cite exacte (#1 à gauche du microscope)
Warning |
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La lampe X-Cite exacte doit être allumée pendant au moins 30 minutes avant d’être éteinte et vice-versa |
Allumez l'alimentation du microscope (#2 module 232 à droite du microscope) Appuyez sur le bouton de démarrage du microscope situé à l'arrière gauche (#3)Allumez la caméra Prime (#4 sur le dessus de la caméra)Allumez l'ordinateur (#5)Utilisez vos identifiants UdM pour vous connecter à WindowsDémarrez le logiciel Zen Blue
Info |
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Lors de la première utilisation il est nécessaire d’importer les paramètres du microscope dans le logiciel. Pour ce faire, suivre les instructions Paramétrage du logiciel. |
UI Expand |
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| Enregistrez vos donnéesFermez le logiciel Zen BlueTransférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C:Éteindre l'ordinateurÉteindre la caméra Prime (#4)Éteindre l’alimentation du microscope (#2) Si la fluorescence a été utilisée, éteindre la lampe X-Cite exacte (#1) Warning |
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La lampe X-Cite exacte doit être allumée pendant au moins 30 minutes avant d’être éteinte et vice-versa | Couvrir l’instrument avec la housse de protection Note |
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| - Récupérez vos échantillons notamment ceux dans le microscope
- Laissez le microscope et l’espace de travail propre
|
UI Expand |
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| - Les fichiers peuvent être sauvés temporairement (pendant l’acquisition) sur le disque local C: (bureau)
- À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe et supprimez-les du disque local C:
- Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. À l’intérieur, créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).
Note |
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Dans tous les cas, ne stockez pas vos fichiers sur le disque C: |
UI Expand |
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title | Paramétrage du logiciel |
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| Lors de la première utilisation, il est nécessaire d’importer dans le logiciel les paramètres spécifiques au microscope. Cette procédure est habituellement réalisée lors de la séance de formation. Il est cependant également possible de l’utiliser pour réinitialiser le logiciel si celui-ci ne s‘affiche pas correctement par exemple. Note |
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Attention, cette procédure supprimera tous vos protocoles d’expérience et rétablira les paramètres originaux du logiciel. |
- Si ouvert, fermez le logiciel Zen Blue et attendre sa fermeture complète (jusqu’à 30 secondes)
- Sur le Bureau ouvrez le dossier Documentation
- Double-cliquez sur Zen Settings for Axio-Imager Z2
- Vous pouvez ensuite réouvrir le logiciel Zen Blue
UI Expand |
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title | Procédure pour le chargement des échantillons |
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| Cette procédure permet de mettre le microscope dans une configuration sécuritaire et d'effectuer une calibration de la mise au point. À la fin de cette procédure le microscope sera prêt pour l'acquisition.CalibrationSur l’écran tactile du microscope : - Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basse
- Appuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette position
- Si nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactile
- Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives>10x pour sélectionner l'objectif 10x
- Si demandé, appuyez sur Done pour supprimer l'avertissement de nettoyage de l'objectif à huile
- Appuyez sur Home>Microscope>XYZ>Position>Z-Position>Set zero>Auto pour effectuer la calibration de la mise au point
- Appuyez sur OK pour lancer la procédure de calibration de la mise au point
- Attendre quelques secondes que la calibration soit terminée
Première mise au pointSur l’écran tactile du microscope : Appuyez sur Home>Microscope>Turret>ObjectivesAppuyez sur 10x pour sélectionner l'objectif 10x
Info | L’objectif 10x est le plus sécuritaire car il possède la plus grande distance de travail (5.3 mm). L'échantillon apparaitra parfaitement net bien avant que l'objectif ne s'approche de celui-ci. Il est recommandé de toujours faire la première mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire. Les objectifs sont para-focaux, faire la mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire |
| vous permettra ensuite de trouver facilement votre échantillon avec avant de sélectionner un autre objectif |
| .Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basseAppuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette positionSi nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactilePlacez votre échantillon sur la platine du microscope avec le couvre-objet vers l'objectifSur l’ordinateur : Ouvrez le logiciel Zen Blue
Info |
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Lors de la première utilisation il est nécessaire d’importer les paramètres du microscope dans le logiciel. Pour ce faire, suivre les instructions Paramétrage du logiciel. | Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (GFP, DsRed, DAPI, etc…) pour activer la configuration
Info |
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Assurez-vous que la lumière soit bien visible aux oculaires avant de continuer. |
et de poursuivre avec la mise au point secondaire. |
UI Expand |
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title | Mise au point avec les objectifs à air |
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| Après avoir effectué la première mise au point, sur l’écran tactile du microscope : Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives Appuyez sur 20x ou 40x pour sélectionner l'objectif désiré Info |
---|
L’objectif 20x est le meilleur objectif à Air car il possède le plus grand nombre de corrections optiques (Plan Apochromat) et la plus grande ouverture numérique (0.8). Il offre une résolution latérale de 420nm à une longueur d'onde de 550nm. |
Ajustez
|
| Ajustez la mise au point avec la molette
|
| principale de précision tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette
|
|
Note |
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Si calibrée, la mise au point est aux alentours de Z = 13 mm) |
Votre échantillon est prêt pour l’acquisition !
|
| Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination secondaire avec les objectifs à l'huile |
| Après avoir effectué |
|
Note |
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Faire d’abord la première mise au point | avec l'objectif le plus sécuritaire avant de sélectionner un autre objectif. | UI Expand |
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title | Mise au point avec les objectifs à air |
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| Après avoir effectué la première mise au point, sur l’écran tactile du microscope : | Appuyez pour Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives Appuyez sur
| 20x ou 40x est le 63x Oil, 100x Oil (1.4) ou 100x Oil (1.4) pour sélectionner l'objectif désiré. Le microscope abaissera automatiquement la platine pour que l'échantillon soit accessible.
| L’objectif 20xL'objectif 63x est le meilleur objectif à |
| Air l'huile car il possède le plus grand nombre de corrections optiques (Plan Apochromat) et la plus grande ouverture numérique ( |
| 084). Il offre une résolution latérale de |
| 420nm 240nm à une longueur d'onde de 550nm. |
| Ajustez la mise au point avec la molette de
Déposer une goutte d’huile sur votre échantillon Appuyez sur Done. Le microscope replacera automatiquement l'échantillon à sa position originale.
Dans le logiciel Zen Blue : Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (GFP, DsRed, DAPI, etc…) pour activer la configuration Ajustez la mise au point avec la molette de précision tout en regardant dans les oculaires jusqu'à
| ce que ce que l'image soit parfaitement
| netteVotre échantillon est prêt pour l’acquisition ! nette Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination Votre échantillon est prêt pour l’acquisition !
|
|
|
UI Expand |
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| Les fichiers peuvent être sauvés temporairement (pendant l’acquisition) sur le disque local C: (bureau) À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe et supprimez-les du disque local C: Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. À l’intérieur, créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).
Note |
---|
Dans tous les cas, ne stockez pas vos fichiers sur le disque C: |
|
UI Expand |
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| Enregistrez vos données Fermez le logiciel Zen Blue Transférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C: Si utilisés, nettoyez les objectifs à huile avec du nettoyant et du papier à lentille Éteindre la barre d'alimentation sur l'étagère au dessus de l'ordinateur (#3) Éteindre la lampe X-Cite exacte (#2) Warning |
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La lampe X-Cite exacte doit être allumée pendant au moins 30 minutes avant d’être éteinte et vice-versa |
Éteindre l'ordinateur Couvrir l’instrument avec la housse de protection
Note |
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| | UI Expand |
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title | Mise au point avec les objectifs à l'huile |
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| Après avoir effectué la première mise au point, sur l’écran tactile du microscope : Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives Appuyez sur 63x, 100x 1.3 ou 100x 1.4 pour sélectionner l'objectif désiré. Le microscope abaissera automatiquement la platine pour que l'échantillon soit accessible. Info |
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L'objectif 63x est le meilleur objectif à l'huile car il possède le plus grand nombre de corrections optiques (Plan Apochromat) et la plus grande ouverture numérique (1.4). Il offre une résolution latérale de 240nm à une longueur d'onde de 550nm. | Déposer une goutte d’huile sur votre échantillonAppuyez sur Done. Le microscope replacera automatiquement l'échantillon à sa position originale.Dans le logiciel Zen Blue : - Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (GFP, DsRed, DAPI, etc…) pour activer la configuration
- Ajustez la mise au point avec la molette de précision tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette
- Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination
Votre échantillon est prêt pour l’acquisition ! |
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id | Trajet lumineux |
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title | Trajet lumineux |
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| Les schémas suivants permettent de suivre le trajet lumineux en lumière transmise (fond clair, DIC) et en lumière réfléchie (fluorescence). PDFview-file |
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name | LightPathZeiss_Zeiss-Z2_Lightpath.pdf |
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height | 250 |
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| Manuels disponibles version anglaise. |
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id | Fiche Technique |
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title | Fiche Technique |
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| Section disponible dans la version anglaise. |
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id | Dépannage et FAQ |
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title | Dépannage et FAQ |
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| Dépannage UI Expand |
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title | Je ne vois pas de fluorescence ! |
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| Le meilleur moyen de résoudre un problème en Microscopie est de suivre le trajet lumineux. À cet effet, Vous trouverez dans l'onglet Trajet lumineux de cette page, vous trouverez les schémas qui vous permettront de suivre la lumière tout le long de son chemin au travers du microscope. Ouvrez le fichier du trajet lumineux En partant de la source lumineuse et en se dirigeant vers le détecteur, vérifiez qu'il y a effectivement de la lumière après chaque composant du microscope
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FAQ UI Expand |
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title | Puis-je utiliser ce microscope pour observer des cellules en culture? |
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| Non. C'est un microscope droit conçu pour l'observation de spécimen entre lame et lamelles (d'épaisseur 0.17mm). |
Plus de dépannage et de FAQs sont disponibles dans la la version anglaise. |
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