1. Enregistrez vos données
2. Fermez le logiciel Zen Blue
3. Transférez vos données sur le disque D: (Data Storage) ou sur votre disque dur externe et les supprimer du disque local C:
4. Éteindre l'ordinateur
5. Éteindre la caméra Prime (#4)
6. Éteindre l’alimentation du microscope (#2)

7. Si la fluorescence a été utilisée, éteindre la lampe X-Cite exacte (#1)

   La lampe X-Cite exacte doit être allumée pendant au moins 30 minutes avant d’être éteinte et vice-versa

8. Couvrir l’instrument avec la housse de protection

• Les fichiers peuvent être sauvés temporairement (pendant l’acquisition) sur le disque local C: (bureau)
• À la fin de chaque session, copiez vos données sur votre disque externe et supprimez-les du disque local C:
• Vous pouvez stocker vos fichiers sur le disque D: (Data Storage). Si vous utilisez ce disque, veuillez créer un dossier par laboratoire en utilisant le nom de famille du chercheur principal. À l’intérieur, créez un dossier par utilisateur (Prénom_Nom).

Lors de la première utilisation, il est nécessaire d’importer dans le logiciel les paramètres spécifiques au microscope. Cette procédure est habituellement réalisée lors de la séance de formation.
Il est cependant également possible de l’utiliser pour réinitialiser le logiciel si celui-ci ne s‘affiche pas correctement par exemple. 

1. Si ouvert, fermez le logiciel Zen Blue et attendre sa fermeture complète (jusqu’à 30 secondes)
2. Sur le Bureau ouvrez le dossier Documentation
3. Double-cliquez sur Zen Settings for Axio-Imager Z2
4. Vous pouvez ensuite réouvrir le logiciel Zen Blue

Cette procédure permet de mettre le microscope dans une configuration sécuritaire et d'effectuer une calibration de la mise au point. À la fin de cette procédure le microscope sera prêt pour l'acquisition.

Calibration

Sur l’écran tactile du microscope :

1. Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basse
2. Appuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette position
3. Si nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactile
4. Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives>10x pour sélectionner l'objectif 10x
5. Si demandé, appuyez sur Done pour supprimer l'avertissement de nettoyage de l'objectif à huile
6. Appuyez sur Home>Microscope>XYZ>Position>Z-Position>Set zero>Auto pour effectuer la calibration de la mise au point
7. Appuyez sur OK pour lancer la procédure de calibration de la mise au point
8. Attendre quelques secondes que la calibration soit terminée

Première mise au point

Sur l’écran tactile du microscope :

1. Appuyez sur Home>Microscope>Turret>Objectives

2. Appuyez sur 10x pour sélectionner l'objectif 10x
   

   L’objectif 10x est le plus sécuritaire car il possède la plus grande distance de travail (5.3 mm). L'échantillon apparaitra parfaitement net bien avant que l'objectif ne s'approche de celui-ci. Il est recommandé de toujours faire la première mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire. Les objectifs sont para-focaux, faire la mise au point avec l'objectif le plus sécuritaire vous permettra ensuite de trouver facilement votre échantillon avec un autre objectif.

3. Appuyez sur Home>Load Position pour faire descendre la platine dans sa position la plus basse
4. Appuyez sur Set Work Position pour mémoriser cette position
5. Si nécessaire, déplacez la mise au point légèrement vers le haut pour supprimer le message « Lower Z limit reached» qui s'affiche sur l'écran tactile
6. Placez votre échantillon sur la platine du microscope avec le couvre-objet vers l'objectif

Sur l’ordinateur :

1. Ouvrez le logiciel Zen Blue
   

   Lors de la première utilisation il est nécessaire d’importer les paramètres du microscope dans le logiciel. Pour ce faire, suivre les instructions Paramétrage du logiciel.

2. Dans l’onglet Locate, sélectionnez BF ou la fluorescence désirée (GFP, DsRed, DAPI, etc…) pour activer la configuration
   
   

   Assurez-vous que votre échantillon soit centré sous l'objectif et que la lumière soit bien visible aux oculaires avant de continuer.

3. Ajustez la mise au point avec la molette principale tout en regardant dans les oculaires jusqu'à ce que l'image soit parfaitement nette

   Si calibrée, la mise au point est aux alentours de Z = 13 mm)  La valeur de la position en Z est visible sur l'écran tactile Home>Z-Position

4. Dans l’onglet Locate, sélectionnez Off pour éteindre l'illumination

Mise au point secondaire 

Le meilleur moyen de résoudre un problème en Microscopie est de suivre le trajet lumineux. Vous trouverez dans l'onglet Trajet lumineux de cette page, les schémas qui vous permettront de suivre la lumière tout le long de son chemin au travers du microscope. 

1. Ouvrez le fichier du trajet lumineux
2. En partant de la source lumineuse et en se dirigeant vers le détecteur, vérifiez qu'il y a effectivement de la lumière après chaque composant du microscope

Non. C'est un microscope droit conçu pour l'observation de spécimen entre lame et lamelles (d'épaisseur 0.17mm).